编辑: hyszqmzc | 2017-11-28 |
条带模糊 不清不统计. 利用
200 bpDNA ladder marker 进行对比,确 定每条引物扩增片段的大小,并将其进行排序. 根据电泳图中扩增的条带有无情况进行赋值,有 条带出现的赋值为
1 ,无条带出现的赋值为
0 ,得到博白大果油茶的 0/1 数据矩阵.利用PopGen32 软件分析博白大果油茶种群多态性 位点百分比(PPB)、Nei'
s 基因多样性(H)、 Shannon 信息多样性指数(I)、种群内基因多 样性(Hs)、种群总基因多样性(Ht)、种群间 遗传分化指数(Gst)和基因流(Nm).并根据 Nei'
s 遗传一致度和遗传距离,确定各种群间的亲 缘关系.
2 结果与分析 2.1 ISSR 扩增产物的多态性 利用已经优化的 ISSR-PCR 扩增体系及筛选 出的
10 条ISSR 引物对
4 个种群的
42 份博白大果 油茶 DNA 样品进行 ISSR-PCR 扩增,10 个引物对
42 份实验材料均能很好的扩增,ISSR-PCR 扩增的 DNA 片段大小一般在
220 ~
2 000 bp 之间,共检 测到
115 条清晰可重复的 DNA 条带,其中多态性 条带为
98 条,总多态位点百分率为 85........