PDF《MiSeq 系统》

10000 9000

8000 7000

6000 5000

4000 3000

2000 1000

10 20

30 40 90% > Q30 图3: MiSeq测序质量数据分布图 MiSeq 系统参数 PhiX 质控文库的测序质量数据,在装有 MiSeq Control Software v2.4 的MiSeq 系统上进行 2*300 bp 测序.此例中 90% 的测序碱基质量均高于 Q30. 仪器配置 RFID试剂追踪 MiSeq Control Software MiSeq Reporter Software 仪器控制电脑 (内置) * 处理器: Intel Core i7-2710QE 2.10 GHz CPU 内存:

16 GB RAM 硬盘:

750 GB 操作系统: Windows 7内置标准版 *电脑配置未来可能更改 操作环境 温度: 22℃ ± 3℃ 温度: 无冷凝, 20%-80% 海拔: 2000米以下 (6500英尺) 空气质量: II级污染以下 通风: 不超过1364 BTU/h 仅可在室内使用 发光二极管 (LED)

530 nm,

660 nm 尺寸 宽度*进深*高度: 68.6 cm*56.5 cm*52.3 cm (27.0 in*22.2 in*20.6 in) 净重: 57.2 kg (126 lbs) 包装毛重: 93.6 kg (206 lbs) 电源要求 100-240V AC @ 50/60Hz, 10A, 400W 无线射频识别装置 (RFID) 频率: 13.56 MHz 功率:

100 mW 产品安全性及遵循法规 NRTL certified IEC 61010-1 CE marked FCC/IC approved 应用范围广泛 测序可以实现的应用范围在不断增加. MiSeq更为快速和简化的测 序流程, 使得它在靶向重测序、 克隆检测、 扩增子测序等应用中, 可 以作为毛细管电泳 (CE)测序的经济替代方案. 优化过的分析流程 也适用于小基因组测序、 16S宏基因组、 RNA测序、 HLA测序、 法医、 植入前遗传筛查 (PGS) 、 植入前遗传诊断 (PGD) , 以及例如TruSeq? Custom Amplicon和TruSeq Custom Enrichment的多重混合应 用. 可调的测序读长、 可选的测序芯片种类, 以及单端或双端测序 的选择, 都前所未有地为多种实验需求提供了相应数据产出的选 择灵活性. Illumina提供的服务、 培训和咨询, 最大限度 地为您提高性能和生产力 无论是在仪器运行过程中需要立即协助, 还是在复杂的流 程中需要深度咨询, Illumina都能帮助您. Illumina的服务 和支持团队提供了一整套应急有效且定制的方案, 从初期 培训, 到仪器支持, 再到NGS的日常咨询. 产品保养服务 ? ? 分级式仪器服务计划 + 附加服务 ? ? 仪器合规服务 ? ? 仪器按需服务 Illumina大学培训 ? ? 在您选定的地点进行讲师带领的培训 ? ? 在Illumina培训中心进行讲师带领的培训 ? ? 在线课程与在线研讨会 Illumina咨询 ? ? 仪器和文库制备检测的原理验证服务 ? ? 协助设计和产品优化的专人服务 ? ? 个性化协助的IT和生物信息学计时咨询 关于Illumina支持产品的更多信息, 请访问: www.illumina.com/services/instrument-services- training.html MiSeq Reagent Kit v2 Read Length Total Time* Output

1 *

36 bp ~4 hours 540C610 Mb

2 *

25 bp ~5.5 hours 750C850 Mb

2 *

150 bp ~24 hours 4.5C5.1 Gb

2 *

250 bp ~39 hours 7.5C8.5 Gb Reads Passing Filter? Single Reads 12C15 M Paired-End Reads 24C30 M Quality Scores?? > 90% bases higher than Q30 at

1 *

36 bp > 90% bases higher than Q30 at

2 *

25 bp > 80% bases higher than Q30 at

2 *

150 bp > 75% bases higher than Q30 at

2 *

250 bp MiSeq Reagent Kit v3 Read Length Total Time* Output

2 *

75 bp ~21 hours 3.3C3.8 Gb

2 *

300 bp ~56 hours 13.2C15 Gb Reads Passing Filter? Single Reads 22C25 M Paired-End Reads 44C50 M Quality Scores?? > 85% bases higher than Q30 at

2 *

75 bp > 70% bases higher than Q30 at

2 *

300 bp MiSeq 系统性能参数 * 总运行时间指在一台可以进行双面扫描的 MiSeq 上完成簇生成、测序、碱基识别所需的时间. ? 安装参数基于 Illumina PhiX 对照文库(对v2 版本试剂簇密度介于筛选后 865-965 k/mm2 ,对v3 版本试剂簇密度介于筛选后 1200-1400 k/mm2 .实际性能 参数可能会因样本种类、样本质量及通过筛选的簇数量而异. ?? 测序质量 >Q30 的碱基比例在整个运行中经过均一化处理. bp = 碱基对,Mb = 兆碱基,Gb = 千兆碱基,M = 百万 了解更多信息 前往 www.illumina.com/miseq, 了解关于桌面式测序仪革新的更 多信息. 参考文献 1. Junemann S, Sedlazeck FJ, Prior K, Albersmeier A, John U, Kalinowski J, et al. Updating benchtop sequencing performance comparison. Nat Biotechnol. 2013;