PDF《宋丹丹》

宋丹丹博士 讲师 硕士生导师 北京理工大学计算机学院 北京市海淀区中关村南大街

5 号北京理工大学 sdd@bit.

edu.cn 教育背景 悉尼科技大学 访问学者 2011.6-2011.7 悉尼科技大学工程与信息技术学院 合作导师:Hung Nguyen 教授(悉尼科技大学工程与信息技术学院院长) 清华大学计算机科学与技术系 博士生 2004.9 C 2009.7 清华信息科学与技术国家实验室(筹) 智能技术与系统重点实验室 曾任清华大学研究生团委联络部部长 计研四班班委 党支部宣传委员 虚拟现实课题组联系人 导师:邓志东教授 清华大学生物信息学教育部重点实验室 访问学生 2008.7-2009.7 清华信息科学与技术国家实验室(筹) 生物信息学部、合成与系统生物学研究中心 美国加州大学河滨分校 访问学生 2007.9-2008.7 美国加州大学河滨分校计算机科学与工程系 导师:Tao Jiang 教授(ACM Fellow, 长江学者) 清华大学计算机科学与技术系 本科生 2000.9 C 2004.7 曾任校团委科创中心宣传组副组长 计零党支部宣传委员 系学生会文艺部部长 计05 班班长 科研兴趣 网页数据挖掘、自然语言处理、生物信息学、机器学习 负责项目

2009 年度 北京理工大学基础研究基金

2010 年度 北京理工大学优秀青年教师支助计划

2011 年度 国家自然科学基金青年基金支助计划

2011 年度 某部队装备综合管理系统

2012 年度 总装备部工程设计研究总院工程图档信息服务系统应用软件 所获奖励

2011 年 北京理工大学青年教师基本功比赛三等奖

2010 年 北京高等教学学会计算机基础课精彩片断交流二等奖 Dandan Song CV

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2 2009 年 清华大学计算机科学与技术系优秀毕业生

2007 年 清华大学综合优秀三等奖学金

2006 年 清华大学人工智能与系统实验室社会工作突出贡献奖

2006 年 清华大学社会工作二等奖学金

2006 年 清华大学研究生优秀团干部

2005 年 清华大学人工智能与系统实验室社会工作突出贡献奖 代表文章 [1] Fei Sun, Dandan Song, Lejian Liao. DOM Based Content Extraction via Text Density. SIGIR

2011 -- The 34th Annual ACM SIGIR Conference. p245-254. (信息检索领域顶级国际会议) [2] Dandan Song, Yang Yang, Bin Yu, Binglian Zheng, Zhidong Deng, Baoliang Lu, Xuemei Chen, Tao Jiang. Computational prediction of novel non-coding RNAs in Arabidopsis thaliana. BMC Bioinformatics, 10(Suppl 1):S36. (生物信息领域顶级国际期刊, SCI, 影响因子 3.493.) [3] Dandan Song, Zhidong Deng. A fuzzy model of predicting RNA secondary structure. Science in China Series F-Information Sciences, 2007, 50(6):846-866. (SCI, 影响因子 0.473.) 宋丹丹, 邓志东. RNA 二级结构预测的模糊模型. 中国科学 E 辑:信息科学, 2007, 37(10):1285- 1303.(国内顶级期刊) [4] Yong Zhang, Jie Wang, Shoujun Huang, Xiaopeng Zhu, Jun Liu, Ning Yang, Dandan Song, Rimao Wu, Wei Deng, Geir Skogerb?, Xiu-Jie Wang, Runsheng Chen, and Dahai Zhu. Systematic identification and characterization of chicken (Gallus gallus) ncRNAs. Nucleic Acids Res., 2009, 37:

6562 - 6574. (核酸研究领域顶级国际期刊, SCI, 影响因子 6.878.) [5] Dandan Song, Zhidong Deng. A Fuzzy Dynamic Programming Approach to Predict RNA Secondary Structure. Proceedings of the 6th Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI'06), Zurich, Switzerland, Sep 11-13, 2006;

LNCS/LNBI, 4175:242-251. (生物信息学算法 优秀国际会议, SCI) [6] Dandan Song, Zhidong Deng. A BP-SCFG Based Approach for RNA Secondary Structure Prediction with Consecutive Bases Dependency and Their Relative Positions Information. International Symposium on Bioinformatics Research and Applications (ISBRA'07) , Atlanta, Georgia, May 7-10, 2007. (生物信息学国际会议, SCI) [7] 宋丹丹, 邓志东. 基于模糊动态规划的 RNA 折叠算法的研究与实现. 中南大学学报(自然科学版), 2005, 36:124-129. (EI) [8] 宋丹丹, 邓志东.一种基于模糊神经网络的 ncRNA 基因预测方法. 东南大学学报(自然科学版), 2009, 39(S1): 139-145. (EI) [9] Dandan Song, Zhidong Deng. A Novel ncRNA Gene Prediction Approach Based on Fuzzy Neural Networks with Structure Learning. The 4th International Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering (iCBBE 2010), Chengdu, China, Jun 18-20, 2010. (EI).