DOCX《Master_Table》

Master_Table Identifiers , Clinical data , Somatic copy number alterations , Mutation counts ,,

Somatic mutation types , Mutation frequencies (MutSig) , Somatic mutations and germline variants , Case USI , TARGET ID , Analysis ID , Data source (Exome/Genome) , AGE , GENDER , NAACCR_ETHNICITY , NAACCR_RACE , year , MYCNamp , hyperdiploid , hist , grade , mki , diag , efstime , stime , 1p- , 1q+ , 2p+ , 3p- , 4p- , 6q- , 7q+ , 9p- , 10q- , 11q- , 12p+ , 14q- , 17q+ , ATRXdel , Total , INDEL , SUB , C>

T , C>

A , C>

G , A>

G , A>

C , A>

T , De_novo_Start_OutOfFrame , Frame_Shift_Del , Frame_Shift_Ins , In_Frame_Del , In_Frame_Ins , Missense_Mutation , Nonsense_Mutation , Nonstop_Mutation , Silent , Splice_Site , Splice_Site_Ins , Splice_Site_SNP , Total per Mb , Nonsilent per Mb , Silent per Mb , Covered bases , Silent , Non-silent , dbSNP overlap , Figure

1 order , ALK , ATRX , PTPN11 , MYCN , NRAS , CHEK2 , PINK1 , BARD1 , PALB2 , TP53 , MUC16 , TTN , AHNAK2 , FLG , FAT2 , FCGBP , MUC17 , MUC4 , RYR1 , ABCA13 , FMN2 , HMCN1 , KIAA1109 , NBPF10 , TNXB , AHNAK , APOB , FBN2 , LRP1B , SPTA1 , SYNE2 , ADAMTS7 , DNAH3 , DNAH5 , DOCK8 , FLG2 , FREM2 , MUC5B , NLRP3 , SI , SVEP1 , TCHH , TNC , USH2A , ADAMTS12 , ANKRD32 , ATP10B , CR2 , CSPG4 , DMXL1 , DNAH1 , DNAH2 , DYNC2H1 , FAM47C , FLT4 , FRAS1 , HSPG2 , INTS1 , KCNJ12 , KDM5A , LENG8 , LY75 , MDN1 , MYH2 , MYO1F , NCOR2 , OBSCN , PLIN4 , PMFBP1 , RELN , REV3L , RP1 , SIPA1L3 , SPHKAP , STK36 , SYNE1 , TDRD6 , TRIO , USP6 , VCAN , XIRP2 , A2M , ABCA9 , ABCC9 , ACACA , ADAMTSL1 , AHR , AKAP4 , ARHGAP20 , ATM , ATP8B1 , AXL , BAT2 , BPTF , BSN , C15orf39 , CACNA1A , CACNA1B , CADPS2 , CDH23 , CELSR2 , CEP290 , CMYA5 , CNTNAP2 , COL11A1 , COL4A1 , COL5A3 , COL6A6 , CPAMD8 , CSMD2 , CSRP2BP , CUL9 , DCHS2 , DDX60 , DNAH11 , DPP10 , DRP2 , EIF2C3 , EP400 , EPPK1 , FAM65A , FANCM , FCRL6 , FLJ10357 , GABRG1 , GLIS3 , GPC2 , GPR116 , GPR125 , GUCY2D , HERC1 , HLA-C , HRNR , HUWE1 , IRF5 , ITGB4 , KIAA0284 , LAMC3 , LATS2 , LILRB1 , LILRB3 , LLGL2 , LRRIQ1 , LSR , MACF1 , MAGEC1 , MLL4 , MTUS2 , MYH6 , NCAN , NEDD4L , NEDD9 , NLRP4 , NLRP5 , NPHP1 , OR2T1 , OR5F1 , OSBPL3 , PCDH9 , PCDHB5 , PCLO , PHRF1 , PKDREJ , PKHD1L1 , PLEC , PRIM2 , PTPRH , PZP , RBMXL1 , ROS1 , RYR3 , SAMD9L , SBF1 , SDK1 , SEC14L5 , SFRS14 , SGSM1 , SIGLEC1 , SLC4A4 , SPEF2 , SPEG , SSPO , STAG1 , STOML3 , TANC1 , TLN2 , TMC1 , TSGA10IP , TUBB4Q , ZCCHC14 , ZFHX3 , ZFHX4 , ZNF292 , ZNF560 , ZNF592 , ZNF814 , ZNF831 , A2ML1 , AASDH , AASS , ABCA10 , ABCA12 , ABCA5 , ABCB11 , ABCD1 , ABO , ACACB , ACAN , ACPL2 , ACSM1 , ACSS3 , ADAM28 , ADAM30 , ADAMTS20 , ADAMTS6 , ADCY10 , AGXT2 , AHCTF1 , AKAP13 , AKD1 , ALAS2 , ALDH16A1 , ALDH18A1 , ALDH1A1 , ALMS1 , ALS2 , AMMECR1 , AMOTL1 , ANK3 , ANKIB1 , ANKRD2 , ANKRD36B , AOC3 , AOX1 , AP3D1 , APOB48R , ARAP1 , ARAP2 , ARHGAP6 , ARHGEF11 , ARHGEF17 , ARID1A , ARR3 , ASB4 , ATP10A , ATP13A1 , ATP2A1 , ATP8B3 , AVPR1A , BAIAP3 , BCAN , BCAS1 , BCL9 , BCLAF1 , BMP3 , BMPER , BRWD3 , BTBD10 , C14orf159 , C16orf45 , C17orf104 , C17orf71 , C17orf98 , C19orf29 , C1orf103 , C1S , C2CD2 , C2CD3 , C2orf16 , C2orf63 , C3 , C7 , C7orf63 , C9orf79 , CACNA1F , CACNA1S , CASS4 , CAT , CBX2 , CCDC13 , CCDC135 , CCDC158 , CCDC39 , CCDC45 , CCT6A , CD163 , CD19 , CD1C , CD33 , CD48 , CDCA7L , CDH10 , CDH12 , CDH5 , CDH9 , CDYL , CEL , CELSR3 , CEP192 , CFI , CHD6 , CHL1 , CHRM5 , CIDEC , CILP2 , CLINT1 , CLPTM1L , CMTM5 , CNOT6 , CNTNAP5 , COIL , COL12A1 , COL14A1 , COL1A1 , COL27A1 , COL28A1 , COL3A1 , COL4A3 , COL7A1 , CPEB3 , CPS1 , CRB1 , CREB5 , CRHR1 , CSF1 , CSMD3 , CSN1S1 , CTAGE1 , CTSG , CTTNBP2 , CUBN , CXCR7 , CXorf1 , CYP17A1 , CYP1A1 , CYP2C9 , CYP4F22 , DAB2 , DCTN1 , DDR2 , DEPDC5 , DGKG , DIAPH2 , DLGAP4 , DMP1 , DNAH10 , DNAH7 , DNAH9 , DNAJC16 , DNASE1L1 , DNHD1 , DNMBP , DOCK3 , DOCK5 , DPP3 , DSC2 , DSCAML1 , DSG4 , DSP , DUSP22 , E4F1 , ECEL1 , ELTD1 , ENAM , ENPP1 , ENPP2 , EOMES , EPB41L2 , EPC1 , EPHA3 , ERBB3 , ERN1 , ERN2 , EVC2 , EXOC1 , F5 , FAM135B , FAM167A , FAM171B , FAM47A , FAM50B , FAM55A , FAM71B , FAM82B , FAT4 , FBN3 , FCRL2 , FCRL5 , FEM1A , FGF3 , FKBP10 , FLAD1 , FLJ46321 , FLNB , FNDC1 , FNDC3B , FOLR3 , FOXA1 , FOXA3 , FOXD4 , FOXD4L1 , FOXP2 , FRMPD1 , FRYL , FXR2 , FZR1 , GABRA6 , GABRE , GABRQ , GAL3ST1 , GAL3ST3 , GALNT13 , GALNT4 , GARS , GBF1 , GCC1 , GDF3 , GDF5 , GIMAP8 , GLDC , GLI3 , GLIS1 , GOLIM4 , GORASP1 , GPR112 , GPR120 , GPR179 , GPR77 , GPR98 , GPRASP1 , GPRIN3 , GSTA1 , GTF3C4 , HCFC2 , HCN4 , HCRTR2 , HEATR7B2 , HELB , HEPH , HERC3 , HIRA , HIST1H2BG , HIVEP2 , HK2 , HMHA1 , HNF1A , HNRNPU , HORMAD2 , HPS3 , HSPA4 , HTT , IFLTD1 , IFT88 , IGBP1 , IGF2BP1 , IGFL3 , IGSF21 , IKZF4 , IL12B , IL13RA1 , IL18BP , IL18RAP , ILDR2 , INPP5D , INTS5 , IQGAP1 , IRF6 , IRF8 , IRS1 , IRS4 , ISM1 , ITGA10 , ITGA2 , ITGA5 , ITGA6 , ITPKB , KALRN , KANK1 , KCNA4 , KCNH3 , KCNH4 , KIAA0319 , KIAA0368 , KIAA0802 , KIAA0913 , KIAA0947 , KIAA1804 , KIF21B , KIF2B , KIR3DL1 , KLF4 , KLHDC7B , KLK14 , KRT1 , KRT10 , KRT24 , KRT6C , KRT71 , KRTAP19-4 , KRTAP4-4 , KRTAP5-10 , LAMA3 , LAMA5 , LAMB2 , LILRA4 , LINGO2 , LOC649330 , LONRF1 , LPA , LPAR4 , LRP2 , LRP6 , LRRC37A3 , LRRC7 , LRRC8E , LRRCC1 , LTBP1 , LUZP2 , MAGEB1 , MAN2A1 , MAN2A2 , MAP3K12 , MAP4 , MARK4 , MBOAT1 , MC2R , MECOM , MED12L , MED13 , MEF2C , MESP2 , MET , MGA , MGAM , MGC42105 , MICB , MIOS , MKI67 , MLL , MLL2 , MLL5 , MLLT1 , MMP1 , MN1 , MNDA , MON2 , MORC2 , MPND , MPRIP , MPZL3 , MRI1 , MRPS35 , MSH2 , MSLNL , MST1 , MUC21 , MUSK , MX2 , MYBPC1 , MYCBP2 , MYH13 , MYH14 , MYH3 , MYH4 , MYH7 , MYO10 , MYO15A , MYO3A , MYO3B , MYOM1 , MYOM3 , MYOT , MYPN , NAV2 , NBAS , NCAM1 , NCAPH , NDST3 , NDST4 , NEDD1 , NEK11 , NEK5 , NES , NF1 , NFATC1 , NFYC , NKTR , NKX2-5 , NKX6-1 , NLGN1 , NLGN4Y , NLRC3 , NLRC5 , NLRP11 , NLRP14 , NLRP8 , NLRP9 , NOTCH1 , NOTCH3 , NPFFR2 , NPY5R , NR3C2 , NRL , NWD1 , ODZ4 , OR14A16 , OR14J1 , OR1S1 , OR2T3 , OR2Z1 , OR4A5 , OR4C12 , OR4D1 , OR4L1 , OR51G2 , OR52D1 , OR52E6 , OR52K1 , OR5AR1 , OR5B21 , OR5L1 , OR5T1 , OR6Q1 , OR7G1 , OR8D2 , ORAI3 , OSBPL8 , OVGP1 , OXR1 , PABPC3 , PANX1 , PAPPA2 , PARD3 , PASK , PAX5 , PBRM1 , PCDHA6 , PCDHB9 , PDE4DIP , PDE6G , PDIA5 , PDZD2 , PEX5 , PEX6 , PFAS , PFKP , PGBD2 , PGLYRP3 , PGM3 , PHF21A , PI4KA , PIGQ , PIK3C2B , PIK3CA , PIK3CB , PIK3R5 , PIK3R6 , PIKFYVE , PITPNM1 , PKD1 , PKD1L2 , PKHD1 , PLA2G4A , PLA2G4D , PLA2G4F , PLAG1 , PLCE1 , PLCXD2 , PLEKHA7 , PLEKHG3 , PLEKHH2 , PLXNA2 , PLXNB2 , PNPLA7 , POF1B , POLD1 , POLR2A , POTEC , PPP1R12A , PPP1R3F , PPP2R5B , PRAMEF10 , PRAMEF11 , PRAMEF12 , PRB3 , PRKAA2 , PRKACG , PRKCG , PRKD1 , PRRC1 , PRX , PTCHD2 , PTGER4 , PTPRB , PTPRM , PTPRT , PUM1 , PXDNL , PYHIN1 , R3HDM1 , RAB5A , RAD50 , RALBP1 , RAPGEF6 , RASAL2 , RASGRP3 , RFPL2 , RGL4 , RIMS1 , RIOK2 , RLF , RNASEN , RNF160 , RNF17 , RNF213 , RNF31 , RNF43 , ROBO3 , RORC , RTN4RL2 , RTTN , S100A14 , SALL3 , SASH1 , SCAF1 , SCN4A , SCN8A , SDR16C5 , SEC16A , SERINC1 , SH3PXD2A , SH3TC2 , SHANK2 , SIGLEC10 , SIGLEC6 , SIGLEC8 , SIGLEC9 , SIN3B , SIRPB1 , SIX1 , SLC13A1 , SLC22A18 , SLC22A5 , SLC25A2 , SLC26A1 , SLC26A9 , SLC45A3 , SLC4A1 , SLC4A9 , SLC6A16 , SLC6A3 , SLC9A2 , SLCO3A1 , SLFN11 , SLIT2 , SND1 , SON , SORCS3 , SORL1 , SP110 , SP2 , SPAG17 , SPRR1A , SRCAP , SREBF2 , SRP19 , SRRM2 , SSBP4 , SSH1 , SSH3 , ST18 , STAB1 , STAB2 , STAT4 , STIL , STON1-GTF2A1L , STOX2 , STXBP5L , SUSD2 , SYCP2L , SYNRG , TACR1 , TAF1L , TAGAP , TBC1D1 , TBC1D22B , TBC1D8B , TBC1D9B , TBX19 , TCEB3B , TCERG1 , TCN1 , TDRD1 , TDRD5 , TEAD4 , TEKT4 , TET1 , TEX13A , TEX15 , TG , TGM6 , THADA , TJP3 , TM9SF4 , TMC6 , TMCO4 , TMEM63A , TMEM67 , TMPO , TMPRSS6 , TNFRSF21 , TNN , TNRC6C , TNS4 , TOPBP1 , TOR2A , TP63 , TPCN1 , TPM2 , TPR , TPTE2 , TRAFD1 , TRIM16 , TRIM58 , TRO , TROAP , TRPM6 , TRPS1 , TRPV5 , TSC1 , TTC3 , TTC5 , TXNL1 , UGT2A3 , UGT8 , UNC5B , UNC93B1 , URGCP , USP43 , USP53 , UTP20 , UTRN , VARS , VPS13A , VPS13C , VPS13D , VWA1 , VWA5A , WDR70 , WDR72 , WDR81 , WNK2 , WNK4 , YAP1 , ZAN , ZC3HC1 , ZEB2 , ZFYVE9 , ZMYM1 , ZNF180 , ZNF208 , ZNF264 , ZNF311 , ZNF318 , ZNF442 , ZNF446 , ZNF460 , ZNF462 , ZNF529 , ZNF683 , ZNF700 , ZNF711 , ZNF746 , ZNF780B , ZNF785 , ZNF804B , ZNF99 , ZP4 , ZSCAN5B , ZSWIM3 , A1CF , AAK1 , AARSD1 , AATK , ABCA2 , ABCA4 , ABCA6 , ABCA7 , ABCB1 , ABCC11 , ABCC2 , ABCC4 , ABCC6 , ABCD4 , ABCF1 , ABHD15 , ABHD2 , ABHD8 , ABI3BP , ABL2 , ABLIM3 , ABTB2 , ACAA1 , ACADSB , ACBD4 , ACBD5 , ACCN1 , ACCN4 , ACCN5 , ACCSL , ACE , ACIN1 , ACOT12 , ACPT , ACRC , ACSBG2 , ACSF2 , ACSL5 , ACSS1 , ACSS2 , ACTBL2 , ACTL6A , ACTL6B , ACTN1 , ACTN2 , ACTR10 , ACTR1B , ACTR8 , ACTRT2 , ACVR1 , ACVR1C , ACVRL1 , ADAM19 , ADAM21 , ADAM22 , ADAM29 , ADAM32 , ADAM7 , ADAMTS17 , ADAMTS2 , ADAMTS5 , ADAMTSL5 , ADCK5 , ADCY2 , ADCY3 , ADD1 , ADD3 , ADH4 , ADNP , ADPRHL2 , ADRA2C , AFAP1L1 , AFF2 , AFF4 , AFG3L2 , AFM , AFMID , AFP , AGA , AGAP1 , AGAP7 , AGBL2 , AGBL5 , AGPAT1 , AGPAT5 , AGT , AHCYL1 , AHDC1 , AHRR , AIFM2 , AIM1 , AK5 , AK7 , AKAP3 , AKAP6 , AKNA , AKR1C3 , ALDH1A2 , ALDH7A1 , ALG13 , ALG5 , ALG6 , ALOX15B , ALPK2 , ALS2CL , ALS2CR8 , AMAC1 , AMAC1L3 , AMACR , AMBRA1 , AMELX , AMOT , AMOTL2 , AMTN , AMY2B , AMZ2 , ANAPC2 , ANAPC5 , ANGPTL4 , ANKMY2 , ANKRD11 , ANKRD13B , ANKRD20A4 , ANKRD24 , ANKRD26 , ANKRD30A , ANKRD34B , ANKRD50 , ANKRD56 , ANKS4B , ANKS6 , ANO2 , ANO3 , ANPEP , ANXA6 , AOC2 , AP1AR , AP1G1 , AP1M1 , AP4E1 , APAF1 , APCDD1 , APEH , API5 , APOL4 , APOM , AQP1 , AQP2 , AQP4 , AR , ARFGEF1 , ARFGEF2 , ARHGAP25 , ARHGAP31 , ARHGAP32 , ARHGAP4 , ARHGAP5 , ARHGDIB , ARHGDIG , ARHGEF10L , ARHGEF12 , ARHGEF4 , ARHGEF9 , ARID4A , ARL13B , ARL2 , ARL6IP4 , ARMC4 , ARMC6 , ARMC9 , ARNT , ARNTL2 , ARPC1A , ARPC2 , ARPP21 , ARRB2 , ARRDC2 , ARSD , ARSG , ARSJ , ARV1 , ARVCF , ASAH2 , ASAP3 , ASB10 , ASB2 , ASH1L , ASH2L , ASPM , ASXL1 , ASXL3 , ASZ1 , ATAD2B , ATAD3B , ATF3 , ATF5 , ATG2A , ATG2B , ATG4C , ATG7 , ATHL1 , ATIC , ATL3 , ATMIN , ATP12A , ATP13A5 , ATP1A2 , ATP2A2 , ATP2A3 , ATP2B1 , ATP2B2 , ATP5J2 , ATP6V1B2 , ATP6V1C2 , ATP6V1E1 , ATP6V1H , ATP8B4 , ATP9B , ATRN , ATXN2L , AVL9 , AVP , AVPR2 , AZGP1 , AZU1 , B3GAT3 , B3GNT1 , B3GNT5 , B3GNT7 , B3GNT9 , B4GALNT3 , B4GALT6 , BAAT , BAG3 , BAGE2 , BAHCC1 , BAT1 , BAT2L1 , BAT2L2 , BBS1 , BBX , BCAS3 , BCAT2 , BCDIN3D , BCKDHA , BCL11A , BCOR , BDP1 , BEST1 , BEST3 , BEST4 , BFSP1 , BIRC7 , BIRC8 , BLK , BLM , BLNK , BMP1 , BMP7 , BMPR2 , BMS1 , BMX , BNIP2 , BPIL1 , BRD3 , BRDT , BRIP1 , BTAF1 , BTBD12 , BTBD2 , BTBD7 , BTD , BTN3A2 , BTNL3 , BYSL , BZW.