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二、 主要学术成绩、创新点及其科学意义 申请者作为独立通讯作者,在微生物生态学方法学和环境微生物耐药性两个方面做出了创新性工作.申请者

第一篇独立通讯作者SCI论文于2010年9月发表在Applied and Environmental Microbiology (美国微生物学会主办,微生物领域被引总数最高杂志,IF 3.686).该研究首次揭示了城市河流沉积物中高度丰富和多样性的超广谱β内酰胺耐药菌和耐药基因类型,提示城市河流可能在耐药菌的社区流行中发挥重要的载体角色.申请者

第二篇独立通讯作者论文于2010年10月发表在The ISME Journal(国际微生物生态领域的权威杂志,由Nature出版集团和国际微生物生态学会ISME合办,IF 6.397).该研究报道了一种新的微生物群落多样性研究手段,比目前最热门的技术更准确,通量更高,而成本下降数十倍.我们并建立了相应的生物信息学分析手段,可以分析前所未有的海量微生物群落数据.这两个方向都有许多新颖的后续研究正在进行中.申请者作为第一作者,在多环芳烃的生物降解机制上做了全面而细致的研究,目前也与刚刚建立的新方法结合,开展更为深入的工作.

(一)微生物生态分析的新方法学及其应用领域:建立了一种新的微生物生态学研究方法――BIPES,可以高分辨率、高通量、低成本地分析微生物多样性,具有广泛的应用前景. 但凡有生命之处,就有微生物的存在――更准确地说,是 微生物群落 的存在.微生物群落多样性与人类健康和环境保护等多个领域密切相关.例如,人体共生菌群与许多代谢疾病有关,感染部位的微生物也常常是以群落形式存在;

土壤、水等环境中微生物则驱动生命基本元素(C,N,S等)进行生物地球化学循环,也是污染物降解转归的主要参与者. 但是,大部分的微生物均不可培养,传统的分子指纹图谱方法仅能分析少量的高丰度菌群,并且不易获得其种属信息.大量测定16S克隆质粒以及芯片法有较好的分辨率,但针对高度丰富的菌群多样性,需要测定大量样品才能得出有效信息,因而成本常常难以承受.因此,微生物生态学的研究一直受方法学限制,迟迟未能突破. 2006年前后,人们同时在人体和环境菌群的研究中建立了一种新的划时代的分析技术――通过454焦磷酸法高通量测序,测定16S可变区序列,通过生物信息学分析,对测的序列的多........