PDF《生物项目数据库（BioProject）使用说明》

1 生物项目数据库(BioProject)使用说明 数据库简介

2 用户注册

2 BioProject 创建

3 2 数据库简介 生物项目数据库 (BioProject) 是收集与共享生物学研究项目信息的资源库, 涵盖的项目类型包括常规组学研究的基因组、转录组、表观组和宏基因组等,并 针对大型项目提供高效、安全、专业化的项目分级管理.

用户注册 用户可借助于中心单点登录 (BIG Single Sign-On, BIG SSO) 技术, 通过 BIG Submission 主页 http://bigd.big.ac.cn/gsub/完成用户账号注册,建议使用实验室公 共邮箱进行注册.如果您在账号使用过程中遇到任何问题,请联系 bigd- [email protected].

3 BioProject 创建 账户注册完成后,即可进入 BIG Sub 统一递交入口,目前 BIG Sub 已集成 BioProject、BioSample、GSA、GWH、GVM、BioCode 等数据库的提交接口, 如 果用户需要向递交组学原始数据归档库(Genome Sequence Archive) 、基因组序 列库(Genome Warehouse) 、或基因组变异数据库(Genome Variation Map)等数 据库递交数据(BioCode 数据库除外) ,都必须先进入 BioProject 数据库创建 BioProject 并完成相关信息填写,具体操作步骤如下: 注:如果用户需要向生物信息工具库(BioCode)递交开源生物信息软件工具,可直接进入 BioCode 数据 库按步骤进行工具递交.

4 注:eGPS:evolutionary Genotype-Phenotype biology 为先导 B 动物复杂性状的进化解析与调控项;

MMDB:Molecular Module-based Designer Breeding System 为先导 A 分子模块设计育种创新体系项目. Release Date 的设置时间,用户可根据项目需求进行设 定,但最长不要超过

2 年. 目前本系统 Umbrella Project 功能只对中国科学院战略 性先导科技专项开发,其他项目此项不必填写. 请选出项目资金来源机构

5 Monoisolate:同一物种且同一基因型样本,主要用于模式动物/植物或细胞系等. Multiisolate:同一物种的多基因型的个体样本 Multi-species:多物种样本集 Environment:环境样本集,样本的种类含量尚不清楚,多用于宏基因组研究 Synthetic:在实验室里制造/合成的样本 Single cell:单个细胞测序得到的序列信息 Other:其他样本/无法归入以上类别的特殊样本 Project Data type 支持多选,Project Data type 列表中不包 括的测序类型,可以选择 others 并在 Project Data type description 中自行添加.

6 注: 用户完成 BioProject 创建后, Status 状态为 Finish;

Cofidential, 系统将自动为用户生成 Accession number. 在管理员审核通过之前,用户可在 BioProject 界面随时修改和删除所创建的 BioProject.管理员审核通过 后, Status 状态会变为 Checked OK;

Cofidential, 到达用户设定的发布日期后, 会变成 Checked OK;

Public. 点击 Submit Project 完成 BioProject 创建.