PDF《bvals: bvecs:》

FA 较大的地方主要是在白质部分.MD 表征水分子在所有方向上的平均弥散距离,如 果没有受到阻碍,则MD 较大;

MD 较大的地方主要在脑脊液.Color FA 的计算方法是第一个特征向量 (first eigenvector, 文件名为 dti_V1.nii.gz)乘上 FA;

第一个特征向量被认为反映(一个体素内)纤维 束的平均方向,所以 Color FA 表示 FA 较大的区域的纤维束的方向.一般地,红色表示左右(X 轴), 绿色表示前后(Y 轴),蓝色表示上下(Z 轴).

四、确定性纤维束追踪 纤维束追踪就是重建出神经纤维束,分为确定性纤维束追踪和概率纤维束追踪两种类型,纤维束追踪需 要对人脑的纤维束有相当的先验知识(而我没有这样的先验知识).这里使用 TrackVis 进行确定性纤维 束追踪.由于纤维束追踪是根据张量拟合的结果进行的,我现在还不清楚是否可以用 FSL 的拟合结果来 作为 TrackVis 的输入,因此需要用 TrackVis 重新进行张量拟合并在此基础上进行确定性纤维束追踪. TrackVis 实际上包含两个相对独立的软件,一个是 TrackVis 用于可视化,一个是 Diffusion Toolkit 用 于张量拟合和纤维束追踪,这里不做区分. (1)准备文件 由于 TrackVis 不能进行涡流/头动校正,使用 FSL 的校正后的结果作为输入.另外,TrackVis 的b- vector 的格式不同于 FSL,首先 FSL 的b-vector 的格式是每列表示一个梯度方向,TrackVis 是每行表 示一个梯度方向,其次 TrackVis 需要去掉 b-value 为0所对应的梯度方向.下面是一个简单的 R 脚本, 将FSL 的bvecs 转换为 TrackVis 的格式: tmp