PDF《西藏藏族 1 5个S》

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5 ] . 这些STRs位点对 于进行亲缘关系较近人群的系统发生和 遗传关系研究非常有用. 本研究拟采用常染色体

1 5个STRs位点多态性研究 西藏藏族群体的遗传结 构并 与邻近人群进行比较, 为研究中华民族群体起源、人群遗传差异、 法医学个体识别、民族特有 疾病谱提供基础资料.

1 对象与方法

1 .

1 对象 为拉萨藏族(卫藏)无关个体101人,划分为汉藏语系藏缅语族喜马拉雅支(http://www.ethnologue.com) . 所有样本的采集遵循3代 以内 均为同一民族的无关个体, 并世代居住于 该地区的原则.本研究样本及所涉及部分参考人群 的基 本情况见表1.1.2DNA分 型从藏族无关个体肘静脉采血,EDTA抗凝, C h e l e x

1 0 0法提取DNA. 用AmpFlS T R L I d e n t i f i e r T M P C R A m p l i f i c a t i o n K i t(A p p l i e d B i o s y s t e m s ,F o s t e r C i t y ,U S A)复合 扩增

1 5个STRs(D8S1179,D21S11,D7S820,CSF1PO, D

3 S

1 3

5 8 , T H

0 1 , D

1 3 S

3 1

7 , D

1 6 S

5 3

9 , D

2 S

1 3

3 8 , D

1 9 S

4 3

3 , v WA, T P O X, D

1 8 S

5 1 , D

5 S

8 1 8和FGA) .操 作按 试剂 盒说 明书 进行, 模板DNA量为1.0~2 . 5n g , P C R 反应总体积为12μ L , 用GeneAmpP C R S y s t e m

9 6

0 0t h e r m a lc y c l e r ( P e r k i n E l m e r A p p l i e dB i o s y s t e m s ,F o s t e r C i t y ,U S A) 进行扩增. 扩增片段用ABIP R I S M

3 1

0 0 A v a n t D N A遗传分析仪(AppliedB i o s y s t e m sD i v i s i o n / P e r k i n E l m e r ,F o s t e r C i t y ,C A) 分析,分型所用标 准参 照物为 等 位基 因ladder(体积标准为GeneScan5

0 0 L I Z , P e r k i n E l m e rA p p l i e dB i o s y s t e m s ) . 用GeneScan3.7和 G e n o t y p e r

3 . 7软件进行基因分型(lanei n n e rs t a n d a r d ) .等位基因命名依据国际法医学会标准( D N Ar e c o m m e n d a t i o n s ,1

9 9

4 ) .

1 .

3 统计学 处理用ARLEQUIN3.1软 件计算等位基因频 率、观察和期望杂合度、哈德 温伯格平衡、 分子方差分析(AMOVA) [

6 ] . 采用Powerstats软 件计算各种法医学应用指标,包括杂合度(Ht)、个体识别力(DP)、非父排除率(PE)等.用DISPAN软 件计算基因分化系数(coefficiento f g e n ed i f f e r e n t i a t i o n , G s t ) 和群体总的基因多样性(H t )值(h t t p : / / m e p .b i o .p s u / d o w n l o d s / d i s p a n . z i p ) .用所 得的15个 S T R s数据与文献报道的其他民族相应资 料计算遗传距离DA, 用MEGAVersion4 .

0 [

7 ] 软件绘制进化树,Bootstrap值 是基于10

0 0 次 重复 .用MICROSATV e r s i o n2 . 0软件计算Fst值, 并将其用于SPSS1

4 . 0软件(S P S SI n c , C h i c a g o ,I L ,U S A) 进行MDS分 析.

1 0

8 中南大学学报( 医学版) ,

2 0

0 8 ,

3 3 (

9 ) 表1本文涉及部分人群的地理来源、 样本量、 平均杂合度( x ± S E ) 和数据来源 T a b .

1 G e o g r a p h i co r i g i n ,s a mp l es i z e s ,o f a l l t h es a mp l e s i n c l u d e di nt h ea u t o c h r o mo s o meS T R s a n a l y s i s , a v e r a g eh e t e r oz y g o s i t i e s ( x ± S E ) , a n dr e f e r e n c e s a r ei n d i c a t e d 人群 简写 样本例 数 平均杂合度 数据来源 拉萨藏族( 卫藏) L a s s a T B

1 0

1 0 .

7 8

1 1±

0 .

0 3

3 2 本课题组 昌都藏族( 康巴) C D T B

7 8

0 .

7 9

3 9±

0 .

0 2

8 5 K a n g LL , e t a l .

2 0

0 7 [