PDF《2017 年创腾科技生命科学分子模拟课程》

88 号2.5 产业园 A2 栋301 室 地理位置 园区图片

六、培训费用

七、交通地图 园区侧门 A2 栋入口 创腾科技有限公司 NeoTrident Technology LTD BeijingShanghaiSuzhou 信息技术带动研发、管理和决策模式的变革与创新 www.neotrident.com 交通路线参考: ? 苏州园区火车站

1、 【沪宁城铁园区站广场站】上车坐

116 路, 【苏州中学园区校站】下车,步行

970 米到.全程约

1 小时

10 分钟.

2、打车最短距离约

11 公里,费用约

30 元. ? 苏州站

1、地铁

2 号线(宝带桥南方向) 【苏州火车站】上车, 【广济南路站】下车换乘地铁

1 号线(钟南街方 向) ,至【钟南街站】下车

1 号口出, 【钟南街首末站南站】上209 路,【2.5 产业园站】下车,步行100 米到.全程约

1 小时

20 分钟.

2、打车最短距离约

21 公里,费用约

55 元. ? 苏州北站

1、地铁

2 号线(宝带桥南方向) 【高铁苏州北站】上车, 【广济南路站】下车换乘地铁

1 号线(钟南街 方向) , 【钟南街站】下车

1 号口出, 【钟南街首末站南站】上209 路,【2.5 产业园站】下车,步行

100 米到;

全程约

1 小时

50 分钟.

2、打车最短距离约

22 公里,费用约

60 元. ? 宾馆名称:汉庭酒店(苏州凤凰新天地店) 0512-62805388 宾馆地址:苏州工业园区南榭雨街

9 号凤凰新天地商业二期

41 幢103 号?宾馆名称:苏州东沙湖邻里商务酒店 0512-67997868 宾馆地址:苏州市工业园区东沙湖路

100 号?宾馆名称:宜必思酒店(苏州工业园区中心酒店)0512-81879966 宾馆地址:江苏苏州市苏州大道东

292 号(地铁

1 号线南施街站

4 号出口处) 注:以上三个经济型酒店供学员参考.周边住宿非常紧张,提醒学员提早预定住宿. 创腾科技有限公司 市场部

电话:021-58353866-219(崔小姐) ,13916476330 021-51821768-233(陈小姐) ,13916858963 Email:[email protected] 培训网站: http://training.neotrident.com/ 创腾科技有限公司 生命科学部

2017 年4月14 日 附件:培训班课程日程安排

八、周边住宿(请学员自行预定,费用自理)

九、培训班联系人 创腾科技有限公司 NeoTrident Technology LTD BeijingShanghaiSuzhou 信息技术带动研发、管理和决策模式的变革与创新 www.neotrident.com 培训班课程日程安排 日期 时间 内容 第一天 08:30-09:00 报到和注册 报到地点:苏州创腾培训中心 09:00-10:30 Discovery Studio 基本界面 DS 背景介绍,DS 界面介绍,DS 入门操作, 抗体、抗原分子的预处理方法介绍与实际操作 10:30-10:45 茶歇 10:45-11:45 抗体理性设计概述 抗体理性设计专题之一:抗体序列的分析 基于抗体序列注释抗体结构域和 CDR loop 区,识别 Gemline 基因,预测翻译后 修饰位点、抗原线性表位. 11:45-13:30 午餐 13:30-15:00 抗体理性设计专题之二:抗体结构的预测(含抗体人源化) 抗体 Fab 区、Fv 区、scFv、全长结构及双特异性抗体结构的构建,CDR 区的优化, 抗体人源化改造策略,基本原理介绍及案例分析 15:00-15:15 茶歇 15:15-16:30 抗体理性设计专题之二:抗体结构的构建(含抗体人源化) 抗体建模参数设置、实际操作技巧及结果分析 16:30-17:15 课程讨论及答疑 第二天 09:00-10:30 抗体理性设计专题之三:抗体-半抗原相互作用预测(CDocker) 抗体-半抗原结合模式的确定,结合位点关键作用氨基酸的分析与确定, 基本原理介绍、案例分析 10:30-10:45 茶歇 10:45-11:45 抗体理性设计专题之三:抗体-半抗原相互作用预测(CDocker) 参数设置、实际操作技巧及结果分析 11:45-13:30 午餐 13:30-15:00 抗体理性设计专题之三:抗体-半抗原相互作用预测(Flexible Docking) 抗体-半抗原结合模式的确定,结合位点关键作用氨基酸的分析与确定, 基本原理介绍、参数设置及结果分析 15:00-15:15 茶歇 15:15-16:00 抗体理性设计专题之四:半抗原连接位点的确定(分子动力学模拟) MD 基本原理,溶剂模型的添加,束缚条件的设定,平衡状态的判定等,半抗原连 接位点的判定. 16:00-16:45 抗体理性设计专题之四:半抗原连接位点的确定(分子动力学模拟) 参数设置、实际操作技巧及结果分析 16:45-17:15 课程讨论及答疑 第三天 09:00-09:45 抗体理性设计专题之五:抗体-抗原相互作用预测(ZDOCK) 创腾科技有限公司 NeoTrident Technology LTD BeijingShanghaiSuzhou 信息技术带动研发、管理和决策模式的变革与创新 www.neotrident.com 抗体、抗原结合模式的确定,结合表面关键残基的分析,抗原表位的识别. 09:45-10:30 抗体理性设计专题之五:抗体-抗原相互作用预测(ZDOCK) 参数设置、实际操作技巧及结果分析 10:30-10:45 茶歇 10:45-11:45 抗体理性设计专题之六:抗体亲和力成熟(虚拟氨基酸突变扫描) 虚拟氨基酸扫描突变,识别能够优化抗体结合亲和力的突变位点,pH 和温度等环 境因素的考虑,原理介绍、参数设置、实际操作技巧及结果分析 11:45-13:30 午餐 13:30-14:15 抗体理性设计专题之七:抗体稳定性优化(虚拟氨基酸突变扫描) 虚拟氨基酸扫描突变,搜索能够稳定抗体结构的突变位点,原理介绍、参数设置、 实际操作技巧及结果分析 14:15-14:45 抗体理性设计专题之七:抗体稳定性优化(二硫键的引入) 二硫键位点的引入与选取,以提高工程单抗的稳定性,实际操作及结果分析. 14:45-15:00 茶歇 15:00-16:15 抗体理性设计专题之七:抗体稳定性优化(抗体聚集效应的预测) 识别抗体结构中易于聚集的位点以进行突变优化,以抗体聚集效应作为指标评价抗 体的稳定性和可发展性以筛选在研抗体, 基本原理介绍、参数设置、实际操作技巧及结果分析 16:15-17:00 课程讨论及答疑 ........