PDF《肝癌基因调控网络研究进展》

1 The relationship among TF, miRNA and target gene[22] . (A) TF directly or indirectly regulate target gene. (B) TF inhibits or activates miRNA to regulate target gene. Meanwhile, miRNA inhibits TF to regulate target gene. ISSN 1000-3061 CN 11-1998/Q Chin J Biotech October 25,

2016 Vol.32 No.10 http://journals.im.ac.cn/cjbcn

1326 3 HCC GRN 研究进展 文中收集近年来肝癌基因调控网络的研 究,不同类型的肝癌基因调控网络研究都取得 了不同程度的进展. 3.1 Co-expression 基因网络研究

2009 年Wong 等研究发现 TOP2A 的高表达 与病毒血管入侵有关[23] .2008 年Lin 等研究含 有247 个肝癌样本分析案例中,ASPM 在66% 的样本中处于高表达状态,该现象也与病毒血 管入侵有关[24] .

2011 年Minguez 等证实 CDKN3 为肝癌病毒血管入侵信号的一部分[25] .这些研 究阐释具有相似功能的基因都倾向于共同表 达.2012 年Drozdov 等利用基因共表达网络研 究肝癌.文中利用网络比较分析

264 个人类芯 片数据,监控并记录肝脏分别在健康状态、肝 硬化状态及肝癌状态下的变化,并用共表达基 因构建肝癌基因相关性网络.通过网络分析得 到几个在网络中连接程度较好的共表达基因, 分别为 ASPM、CDKN

3、NEK

2、RACGAP

1、 TOP2A,并发现 NEK2 与RACGAP

1、ASPM 与TOP2A、CDKN3 与TOP2A 分别具有较高的皮 尔森相关系数值,其中 TOP2A 在肝癌中处于高 表达状态[12] .因此基因共表达网络可以通过一 些未知基因的共表达功能性质来识别它们的生 物特征角色,这对研究肝癌或其他癌症具有重 要意义. 3.2 miRNA-gene 调控网络研究

2010 年Burchard 等通过构建

96 对肝癌肿 瘤组织与非肿瘤组织的 miRNA-gene 调控网络, 发现 miR-122 在肝癌中低表达,其参与调控的 通路发生功能紊乱,并且 miR-122 可作为肝癌 的预后标记[26] .miR-122 调节线粒体的代谢, 其下调可能损害肝脏关键功能,导致肝脏病人 发病率及死亡率的提升.2012 年Huang 等通过 构建 miRNA-gene 调控网络发现

3 个与细胞增殖 相关的miRNA :........