PDF《Reaxys使用》

39 ? Reaxys的基本介绍和数据索引 ? Reaxys最新更新(近期即将) ? Reaxys中的检索 ? Reaxys中结构面板高级应用 ? Reaxys中的高级反应检索 ? Reaxys中的合成计划设计 ? Reaxys检索小结 提纲 ? 检索以下反应 ? 吡啶环上存在一个硝基,一个卤素,且这两个官能团处于邻位 ? 反应过后硝基还原成氨基 ? 定义难点:如果确保NO2和卤素处于邻位

40 Case Study

1 41 Reaxys中的结构定义 结构定义: 1:使用两次不定 位取代,将NO2 和X定义在吡啶 环上 2:使用原子映射 功能,将反应前 后的原子标记出 来3:As Draw检索 不定位取代的定义 1:选择需要链接基团的原子,用不定位取代健和不同的基团相连 2:吡啶环上的5个C原子需要使用两次不定位取代,一次链接X,一次链接NO2

42 检索到的结果 检索到的反应,存在 NO2和X在邻位的,也 存在对位的反应 ? 想要的一定属于这个结果集的子集,可以直接使用过滤工具

43 如何对反应进行筛选

44 输入限定的结构 1,打开元素周期表,选择Atom List定义C,N 2:在6元环上,将其余4个C全部换成List

45 添加结构后的界面

46 最后的结果 这种检索,出来 的NO2和X都处 于邻位 ? 当结构中存在一些特定要求,无法一次定义完全的时候,可以采用分 次定义的方式 ? 两次定义的结构,并不存在包容关系,这和通常意义上的限定不太一 样?采用这种限定拿到的结果,是单独检索这两个结构的交集 ? 采用这种限定策略,限定结构时必须将原有结构删除

47 案例小结 ? 复杂结构中的常见问题 ? 反应中心,只是一个简单的化学变化 ? 反应物/产物,结构复杂或者新颖 ? 需要选择性的氧化,还原,脱保护等 ? 检索符合以下条件的反应 ? 结构中存在Boc和苯甲醛 ? 反应后苯甲醛变成苯甲醇

48 Case Study

2 49 Reaxys中的定义 1:亚结构检索 2:添加环的保护,Additional Ring closures. 3:S*,Atom Mapping |

50 Reaxys中的结果 在不做任何设置的 情况下,会获得两 个片段在不同结构 中的反应

51 Reaxys在结构定义时直接定义碎片为一个整体 New Reaxys定义的时候,可以直接选择Fragments是否在一个片段中

52 最后的结果 从结构上看,所有的结构中都包含2个片段 |

53 ? 检索以下的反应 ? 常规做法如下 Case Study

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54 ? 实际的情况 ? 由于空间位阻的问题,无法取代NH2 ? 由于砜也是一个离去基团,砜基团在第二步反应时脱落 ? 修改的思路 ? 先变成亚砜,取代NH2后,在变成砜 实际上的情况 |

55 常规的检索 |

56 检索到的结果 常见的不符合要求的反应: 1. 亚砜变成亚砜的 2. 砜变成砜的 3. 硫醚变成砜的 |

57 ? 不符合要求的反应 ? 亚砜变成亚砜的 ? 砜变成砜的 ? 硫醚变成砜的 ? 原因分析 ? S原子在进行检索时,价态的变化而导致 ? 如何解决 ? Solution 1:S*的应用 ? Solution 2:v+/v-的应用 问题解决出发点 |

58 Solution 1:S*的应用 利用S Lock将反应物,产物中的S锁定即可 |

59 Solution 2:v+/v-的应用 Tips: 1. V+/V-的定义,表示被标记的原子的价位 2. 类似的情况还有,氮氧化合物 |

60 最后的结果 |

61 ? 检索以下反应,将Br变成羰基 Case Study

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62 检索到的结果 不符合要求 符合要求 |

63 ? 不符合要求的反应 ? C=O在原来反应物中带过来 ? 不是在Br的地方换成C=O ? 原因分析 ? 不定位取代的时候没有办法做原子映射 ? 如何解决 ? Solution 1:As Draw能否解决? ? Solution 2:As Substructure的话,如何筛选? 如何解决 |