PDF《MiSeq® 系统指南》

2012 年7月更新了 MCS v2.0 的软件描述. 添加了以下新信息: ? 添加了标题为 MCS 中的新增内容的小节,用于描述 新软件功能、界面更改和工作流程更改 ? 添加了 MiSeq 试剂盒 v2 的商品目录号和描述,500 次循环 ? 添加了 版本兼容性和要求 小节 ? 添加了

14 小区双面流动槽成像所需的 MiSeq 扩展包 的描述 ? 添加了双面流动槽小区编号的描述 ? 添加了 Nextera XT 文库的 PCR 扩增子分析工作流 程?添加了 10% Tween

20 在清洗过程中的使用和预期清 洗量 ? 为RFID 读取失败过程添加了试剂盒版本 更新了以下信息: ? 将IMF、CMF和AMX的试剂缩写分别更改为 v2 试 剂名称 IMS、CMS 和AMS ? 将PhiX浓度从

8 pM 更改为 12.5 pM ? 将建议的最终溶液的最大 NaOH浓度更改为

1 mM ? 提到需要先进行维护清洗,然后取消仪器的备用模式 并开始后续运行的设置步骤 ? 删除了 样品表参数 部分和工作流程中的样品表设 置步骤;

Illumina 建议在样品制备之前创建样品表 (请参见《MiSeq 样品表快速参考指南》,部件号

15028392 和《Illumina Experiment Manager用户指 南》,部件号 15031335). vi 材料号

20000262 文档号

15027617 v01 CHS 文档号 日期 更改描述 部件号

15027617 修订版 C

2012 年4月仅提供英文版. 更新了 MCS v1.2 的软件描述 添加了以下新过程和小节:BaseSpace概述、使用自 定义引物、生成 FASTQ 文件、解决流速错误、执行 容量测试、执行维护清洗以及使仪器闲置,包括备用清 洗. 更新了以下信息: ? 将扩增子工作流程的名称更新为自定义扩增子;

将短 序列组装工作流程的名称更新为组装;

添加了生成 FASTQ 工作流程 ? 添加了运行文件夹和文件的描述;

更新了运行文件夹 命名;

添加了输出文件大小 ? 在 样品表参数 中将基因组文件夹列为扩增子测序 的必需内容 ? 添加了有关稀释 NaOH以使文库变性的说明 ? 更新了 解决 RFID 读取失败 以包括 MiSeq 自我服 务说明 ? 列出了用于对运行性能进行故障诊断的文件和文件夹 部件号

15027617 修订版 B

2011 年12 月 仅提供英文版. 更新了 MCS v1.1 的软件描述 添加了有关防病毒保护的信息 更新了以下信息: ? 解决 RFID 失败的说明 ? 制备文库 ― 更改为 0.2 NNaOH ? 运行文件夹命名约定 ? 所需磁盘空间和存储容量 ? 运行设置步骤 ― 添加了有关 设置样品表 的更多 信息 ? 运行设置步骤 ― 添加了处置剩余 PR2 的注意事项 ? 分析持续时间 ― 添加了分析超过两小时的情况 ? 分析输入要求 ― 将清单文件列为 TruSeq 自定义扩 增子文库的必需内容 ? 更正了 MiSeq 试剂盒溶液 中的 HT1 管尺寸 ? 更改了对 MyIllumina 的iCom参考 部件号

15027617 修订版 A

2011 年9月仅提供英文版. 最初版本 目录 修订历史记录 iii 目录 vii 第1章概述

1 简介

2 更多资源

3 组件

4 MiSeq 概念

6 MiSeq 软件

7 二级分析选项

9 Sequencing Analysis Viewer

11 所需磁盘空间

12 MiSeq 试剂盒概述

13 第2章入门

15 启动 MiSeq

16 自定义系统设置

17 配置 BaseSpace 更新的通知

18 设置电子邮件首选项

18 设置默认的文件夹位置

18 用户自备的耗材

19 第3章测序

21 简介

22 运行持续时间

23 MiSeq 工作流程

24 解冻试剂盒

26 检查试剂盒

27 变性和稀释文库

28 装入样品文库