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北京中科云畅应用技术研究院 zkyc-02-1912 "微生物宏基因组学与 16S"高级实操班邀请函 尊敬的老师您好: 近年来,随着现代分子生物学的发展,特别是人类基因组计划的实施,不断产生出巨量的分子 生物学数据,这些数据有着数量巨大、关系复杂,以至于不利用计算机根本无法实现数据的存储和分 析.

生物信息学大量的使用计算机技术进行分析工作,这就要求技术人员熟悉多种分析软件的使用方 法及其在生物各领域的应用技术.为进一步推动我国生物信息学的发展,提高从业人员的技术水平, 北京中科云畅应用技术研究院在中国电子学会(国家专业技术人员继续教育基地) 的支持下举办此学 习,并由北京中科润开生物科技有限公司具体承办,具体事宜通知如下: 指导单位:中国电子学会(国家专业技术人员继续教育基地) 主办单位:北京中科云畅应用技术研究院

一、主讲专家: 主讲专家来中科院等科研机构的高级专家, 拥有丰富的科研及工程技术经验,长期从事生物数据 分析与挖掘,基因测序等工作,以第一作者发表 Nature, Nature Cell Biology, Molecular Cell, Science Translational Medicine, Cell Res 等杂志

40 多篇.

二、培训对象: 大中专院校生物信息、生物计算、生命科学、医学、化学、农学、计算机科学、数学类专业的课 程负责人、一线教师、教研室骨干人员、教学管理人员;

科研单位从事生物、生命科学、微生物研究 的相关人员;

生物、医药、化学及相关企业的领导与技术骨干.

三、报名须知: A 类: ?RMB:2900 元/人,(包含报名费、培训费、资料费、证书费)食宿可统一安排,费用自 理学员,经培训考试合格后可以获得:由北京中科云畅应用技术研究院 颁发的结业证书 B 类: ?RMB:3200 元/人,(包含报名费、培训费、资料费、证书费)培训结束经考核合格,可 获得由中国电子学会颁发全国电子信息人才能力提升工程专业《数据分析工程师》技术证书, 依据 人力资源与社会保障部《国家级专业技术人员继续教育基地管理办法》(人社厅发〔2013〕53 号) 的要求,本次学习情况,本次学习情况可计入继续教育学时并作为对专业技术人员考核评价、职称 评聘、聘用和执业注册的重要依据.须提交电子版彩色照片,身份证复印件. 请各有关部门统一组织本地区行政、企事业单位报名参加培训,各单位也可直接报名参加,报名 回执表请邮件发送至会务处.

四、时间地点:2019 年7月19 日――7 月22 日 宏基因组学与 16S 上机实操班(大连) (时间安排:第1天报到,授课

3 天)

五、课程内容: 微生物宏基因组学与16S 上机实操班课程大纲

一、微生物基因组

1、微生物基因组和转录组学研究 1.

1、微生物基因组研究的意义 1.

2、微生物基因组研究概况 1.

3、微生物基因组的特点 1.

4、微生物转录组学研究

2、微生物基因组常用软件介绍 2.1 微生物基因组在线圈图分析 2.2 代谢通路分析(KEGG & KAAS) 2.3 病原菌耐药基因鉴定(CARD & Resfinder) 2.4 细菌基因组岛鉴定 (Islandviewer)

二、Linux 系统操作简介 2.1 Linux 简史 2.2 Linux 与生物信息学 2.3 Linux 基本命令 2.4 Linux 基本操作综合实践

三、宏基因组学 1. 16S rDNA AMPLICON SEQUENCING 法1.1. 测序平台、引物设计及区域选择不同测序平 台、针对细菌、真菌不同微生物实验设计 1.2. 测序量及采样建议 针对水体、粪便、土壤、物体表面、口腔等不同生 境1.3. 分析流程图 数据收集、数据预处理、数据分析 1.4. 结果解析 1.4.1 OTU 聚类 1.4.2 物种注释 1.4.3 物种分布情况 1.4.4 样品复杂度分析:α多样性 Coverage Chao 指数 ACE 指数 Shannon 曲线 Richness rarefaction 曲线 1.4.5 多样品比较分析:β多样性 样品间物种丰度热图 排序分析: PCA 分析 PCoA 分析 NMDS 分析 Unifrac 分析 样品聚类分析 2. DSS (direct?shotgun?sequencing)法2.1. 分析流程 2.2. 功能注释分析 2.3. 代谢途径解析