PDF《用户使用说明书》

2015 王亚楠 中科院昆明植物研究所 2015-8-1 用户使用说明书 iFlora 智能植物志用户使用说明书 http://www.

iflora.cn/Default.aspx 第1页目录

1 数据库简介

2 1.1 iFlora-中国常见植物专题.3 1.2 iFlora-国家重点保护植物专题.3 1.3 iFlora-中国药典植物专题.5 2. 系统要求

6 3.功能模块

6 3.1 首页

7 3.1.1 智能提示.8 3.1.2 模糊搜索.8 3.1.3 相似度搜索

8 3.2 图片认植.9 3.3 条形码鉴定.10 3.4 名录索引.11 3.5 分等级检索.11 3.6 高级搜索.12 3.7 详细页面.13 3.8 关于本库.14 3.9 iFlora 移动版下载.15 iFlora 智能植物志用户使用说明书 http://www.iflora.cn/Default.aspx 第2页1数据库简介 iFlora 是将植物学、DNA 测序技术与信息技术相结合,通过系 列关键技术的集成和攻关而研制,集标本(样品)收集、遗传信息 获取、形态学和 DNA 数据分析为一体,为植物学专家、政府部 门、行业和公众提供便捷、准确识别植物和获取相关信息的新一代 植物志 (智能化装备) . 通过工作机制的建立和标准规范的制定,依托已建设完成的科 学数据库、研究所各科研部门深厚数据积累为基础,对iFlora 研建 急需的核心数据、基础数据和拓展数据三级信息水平上进行系统整 合,构建我国维管植物 iFlora 标准数据库(Reference Library) ,据 此建成了支撑数据汇聚、融合和服务的应用平台――iFlora 信息平台 (http://iflora.cn) .平台的建成将为 iFlora 的研制和应用提供全方位 的信息化支撑,为海关、司法、药检等政府决策部门和社会公众便 捷、准确了解与获取植物多样性和遗传信息提供全新的认知方式和 平台.带动培育和拓展我国物种识别圈(Taxasphere)和生物文化圈 (Bioliterate World) ,为物种起源、系统进化和生命之树等研究提供 基础数据和研究启示. 目前,平台已完成涉及

300 科3434 属39971 种(含种下等级) 物种的核心数据、基础数据和拓展数据三级信息的整合,并已发布 中国常见植物 DNA 条形码数据库 、 国家重点保护野生植物 DNA 条形码数据库 、 中国药典药用植物 DNA 条形码数据库 三 个专题的数据库. iFlora 智能植物志用户使用说明书 http://www.iflora.cn/Default.aspx 第3页1.1 iFlora-中国常见植物专题 十二五 期间拟完成中国常见维管植物科属的 iFlora,即完成 中国维管植物 80%属(约2747 属) ,25%种(约8000 种)的iFlora 构建.在已建设完成的相关数据库和研究所各科研部门深厚数据积 累的基础上,从iFlora 研建急需的核心数据、基础数据和拓展数据 三级信息水平上进行系统整合,建设了支撑数据汇聚、融合和服务 的应用平台,构建了我国常见维管植物 iFlora 标准数据库 (Reference Library) ,全方位支撑 iFlora 的研制和应用.该数据库 和应用系统的建设将为国家相关产业部门和公众便捷、准确了解与 获取植物多样性和遗传信息提供全新的认知方式和平台. 目前,本应用系统涉及

244 科、1842 属、7570 种,DNA 条形 码90975 条、植物照片

87082 张、采集信息

18524 条、种质资源信 息31671 条、民族植物学

4717 条、标本信息

127 万余条(来源 CVH) . 1.2 iFlora-国家重点保护植物专题 新一代智能植物志 iFlora 计划的阶段性目标之一是构建中国维 管植物和重要大型真菌的开放、共享的数据平台.结合中国科学院 昆明植物研究所 一三五 任务的实施,在国家科技部科技基础性 工作专项项目和国家高技术研究发展计划项目的支持下,项目组依 托中国西南野生生物种质资源库、中国科学院生物多样性和生物地 理学重点实验室(标本馆)和科技信息中心,构建了 iFlora 的一个 重要共享平台― 国家重点保护野生植物鉴定信息平台 iFlora 智能植物志用户使用说明书 http://www.iflora.cn/Default.aspx 第4页(http://iflora.cn/IF/Protectedplants/Default.aspx) . 《国家重点保护野生植物名录》是我国政府正式发布的一个保 护植物名录,所列物种分为 I、II 两个保护级别.第一批名录于

1999 年8月4日经国务院批准,在1999 年9月9日由国家林业局 和农业部联合正式颁布施行,包括了

92 科194 属254 个类群(I 级51 个,II 级203 个) .由于植物分类学者在某些分类处理上存在不 同看法,因此,在实际应用时,对第一批名录的物种数统计并不完 全一致.例如,中国数字标本馆(CVH)接受的物种数为

285 种 (含亚种和变种,下同) ;

基于 Flora of China 统计的物种数则为

305 种. 该平台是依据《国家重点保护野生植物名录》 (第一批)进行构 建的,为了尽可能全面地覆盖该名录所列类群,项目组组织专家进 行了为期两年的材料整理和采集,完成了名录所列 90%类群的样品 收集(其余 10%的类群主要是因为极度濒危,甚至在野外无法采 到) ,并采集了对应的标本和照片.依托种质资源库的分子生物学实 验平台,分别获取了采集样品的

4 个DNA 条形码片段(ITS、 matK、rbcL、trnH-psbA) ,约计

3000 个DNA 条形码.利用相关数 据库和计算机技术,通过构建 国家重点保护野生植物 DNA 条形 码参考型数据库 ,初步建设了 国家重点保护野生植物鉴定信息平 台 . 该平台以保护目标植物(真菌)类群 DNA 条形码数据的获取 为基础,并整合了部分近缘类群的 DNA 条形码数据,以及相关的 物种信息、种质资源信息、实物照片信息和地理信息等,提供了快 速搜索、图片识别、DNA 条形码、名录索引、分等级检索、分省名 iFlora 智能植物志用户使用说明书 http://www.iflora.cn/Default.aspx 第5页录和高级搜索等

7 个认知植物的功能和入口,让用户不仅能够快速 找到和识别自己的搜索目标,而且在搜索过程中能够快速认知和准 确鉴定国家重点保护野生植物. 该平台的建成将为我国生物多样性研究、保护和可持续利用提 供重要的技术支撑,同时对宣传和普及植物科学知识、提高公众对 生物多样性的认知等方面将发挥重要作用.有利于国家相关行业, 特别是林业、农业和海关等相关部门对国家重点保护野生植物的保 护和监管,为我国生物多样性保护与可持续发展和生态文明建设做 出贡献. 1.3 iFlora-中国药典植物专题 《中华人民共和国药典》 ,简称《中国药典》 .是由国家药典委 员会,根据《中华人民共和国药品管理法》的规定,负责组织编纂 《中华人民共和国药典》及制定、修订国家药品标准,是法定的国 家药品标准. 《中华人民共和国药典》2010 年版是

2012 年7月5日由卫生部发布公告(2012 年第

12 号) .收载品种总计

4567 种,其 中新增

1386 种.药典一部收载药材和饮片、植物油脂和提取物、成 方制剂和单味制剂共计

2165 种,涉及药用植物

805 种. 为了帮助国家相关产业部门和公众便捷、准确了解与获取中国 药典中药用植物及其相关植物物种信息,本应用系统专门建设了 iFlora-中国药典植物专题 (http://iflora.cn/IF/poc/Default.aspx) .该专题数据库和平台涉及植物

142 科、440 属、805 种,DNA 条形码

10794 条、植物照片

21410 张、采集信息

1716 条、种质资源信息

7494 条、民族植物学

1176 iFlora 智能植物志用户使用说明书 http://www.iflora.cn/Default.aspx 第6页条、标本信息

25 万余条(来源 CVH) . 2. 系统要求 根据软硬件的要求,服务器的最低要求如下: CPU:Intel Pentium

300 硬盘:20GB 高速 IDE 硬盘(最好配置 SCSI 硬盘) 内存:256M 以上 声卡:32 或64 位以上全双工声卡 显卡:显存 4M 以上,24 位真彩色 网卡:100Mbit/s 客户端最低如下: CPU:Intel Petium

200 内存:32M 显卡:2M,16 位真彩色 3.功能模块 平台........