PDF《3.2.2. 化合物结构数据库》

30 图3.2.2.18 上传分子结构的 MOL 文件进行检索(例7) 图3.2.2.19 将ISIS Draw 软件绘制的分子结构导出为 MOL 文件 检索过程第二步:获得检索命中的目标化合物列表 点击提交检索之后,系统将对结构数据库进行检索,查询符合用户要求的化合物,并将命中的目标化合物 列表显示.如图 3.2.2.20. 图3.2.2.20 命中的目标化合物列表(例6) 图3.2.2.21 化合物的属性

31 点击第

2 个化合物命名的链接,即可查看该化合物的属性,如图 3.2.2.21.页面上除了结构、名称之外,还 可以在页面的下端看到该化合物在其它数据库的信息.点击这些链接,即可检索该化合物对应的信息. 点击英文文献,即可检索到与该化合物相关的所有英文文献,共5558 条纪录,列表如图 3.2.2.22,所示. 在表中点击文献名的链接,可查看该文献的信息,如图 3.2.2.23,图中仅显示出一部分文献相关化合物. 图3.2.2.22 化合物的相关英文文献 图3.2.2.23 化合物的相关英文文献的详细信息 点击化学专利,即可检索到与该化合物相关的所有专利文献,共1669 条纪录,列表如图 3.2.2.24 所示.在 表中点击专利名的链接,可查看该专利的信息,如图 3.2.2.25,图中仅显示出一部分专利相关化合物. 图3.2.2.24 化合物的相关专利文献

32 图3.2.2.25 化合物的相关专利的详细信息 点击相关试剂,即可检索到该化合物作为化学试剂的供应商,共1条纪录,列表如图 3.2.2.26 所示.在表 中点试剂名的链接,可查看该试剂的信息,如图 3.2.2.27. 图3.2.2.26 化合物及其试剂供应 图3.2.2.27 化合物试剂的详细信息

33 图3.2.2.28 化合物危害性的详细信息 点击危害性,即可检索到该化合物的危害性信息,如图 3.2.2.28. 3.2.2.3 化合物子结构检索 (尚在建设中) 3.2.2.4 化合物模糊结构检索 基本原理 用户在页面上输入化合物的二维结构,或者上传化合物的 MOL 文件(可用 MDL 公司的 ISIS DRAW 软件绘制结构,导出为 MOL 文件),选择被检索结构的拓扑和其他特征,系统以提问化合物为基础,检 索符合某些结构特征的目标化合物. 检索过程第一步:输入化合物的结构并选择检索结构的特征 输入化合物的结构有

2 种方法,输入方法与 3.2.2.2 相同(略) . 检索结构的特征分成如下

6 类.选择某项表示要求目标化合物的该属性当与提问化合物相同,不选择则表 示任意值均可. 1) 结点(原子)计数匹配项目:选择此类表示目标化合物的结点属性需与提问化合物符合,因此可以检出不 同的拓扑骨架.结点属性包括:非氢结点(原子)数目、连接度是 3/4/大于

4 的结点(原子)的数目、氢 同位素氘/氚原子的数目. 2) 键计数匹配项目: 选择此类表示目标化合物除单键以外的各类的化学键数目和电荷数需与提问化合物一致, 因此可以检出不同的拓扑骨架,但是具有相同的双键数、三键数、互变键数、芳香键(单双键交替)数和 电荷数的化合物. 3) 环系统匹配项目:选择此类表示目标化合物的环系统属性需与提问化合物符合,因此可以检出不同的拓扑 骨架,但命中化合物的环系统属性需相同.环系统属性包括:环系统总数目、每个环系统的环结点计数、 每个环系统的小环数、每个环系统的 SSSR(最小环集的最小集) .注意:可能存在一个或几个不同环系统 具有相同环系统属性的情况,因此即使全选此项,某些较复杂环系统的提问化合物的环系统也可能与目标 化合物的环系统不完全一致,例如 triphenylene 可能检索到 tetraphene. 4) 立体中心计数匹配项目:选择此类表示目标化合物的立体属性需与提问化合物符合,对于有立体标记的化 合物应当勾选此项,否则将无法得到想要的结果.立体属性包括:节点立体化学、键立体化学、轴立体化 学. 5) 重复单元/组计数匹配项目:选择此类表示目标化合物的重复单元属性需与提问化合物符合,对于有重复单 元标记的物质应当勾选此项,否则将无法得到想要的结果.重复单元属性包括:重复单元、重复组数. 6) 分子式结构匹配项目: 此类有