PDF《一,夏成柱 ,胡桂 学2,谢之景 1》

第l9卷 5期2004年 l O月中国病毒学VI RoL oGI CA S I NI CA l

9 ( 5) :4

8 1 .

4 8

6 Oc t o b e r

2 0

0 4 犬冠状病毒大熊猫株纤突蛋白全基因的克隆与序列分析 乔军,一,夏成柱 ,胡桂 学2,谢之景

1 ,闫芳,杨松涛 ,黄耕(1.中国人 民解放 军军事医学科学院军事兽医研究所 ,吉林长春

1 3

0 0

6 2 :2 . 吉林农业大学动物科技学院,吉林长春

1 3

0 1

1 8 :3 . 塔里木 农垦大学动物科技学院,新疆阿拉尔

8 4

3 3

0 0 ) 摘要 :在 国内首次对犬 冠状 病毒大 熊猫 野毒株 ( C C VDX MV)纤突蛋 白基 因进行 了克隆和序列 测定 .该基 因全长

4 3

6 2 b p , 编码

1 4

5 3 个氨 基酸 , N端前 l

8 个氨基酸 为推测 的信 号肽序列 , 后1435个氨基 酸构成成 熟蛋 白. 与Ge n Ba n k 中 已发表 的l1个CCV毒株 s基因相 比,s基因核苷酸序 列同源性在

4 0 .

2 %~9

9 .

5 %之间 ;

推 导的氨基酸 序列 同源 性在

1 5 .

9 %~9

9 . O %之间. DX MV株 s基 因变 异区主要集 中在 该基 因前

1 / 2处,其中350.

370、439-

478、1

7 1

8 .

1 8

1 8 三个 区域 碱基变异较 大,而1060.1700区却十分保 守.基于 s全基 因及其蛋 白的聚类分析表 明,DX MV 株与 K3

7 8 、 N VS L和US p a t e n t 株 亲源关系最近 . 推 导的 D XMV株 s蛋 白氨 基酸序 列潜在 的N. 联糖基 化位点与 C C V 强毒 V5

4 相同,为34个 , 比Insavc.1弱毒 多一个;

其 中第

5 6

6 .

5 6 8位糖基 化位点为 多数强毒拥有 而弱毒没有 的 .另外 , D XMV株 S蛋 白疏水性及抗 原表 位与 其它毒株有一 定的差异 ,这些差 异对 DX MV 株致病 性和免疫原 性等影 响尚 待进一 步的研究 . 关键 词:犬冠状病毒 大熊猫株 ;

纤突蛋 白基因 ;

克隆;

序列 分析 中图分类号:$

8 5

2 .

6 5 文献标识码: A 文章编号:1

0 0

3 .

5 1

2 5 (

2 0

0 4 )

0 5 .

0 4

8 1 .

0 6 Cl o n i n g a n d S e q u e n c e An a l y s i s o f S p i k e Pr o t e i n Ge n e o f Ca n i n e Co r o n a v i r u s Gi a n t Pa n d a '

s I s o l a t e Q I AO J u n '

,XI A X i a n ― z h u ,H U G u i ― x u e

2 ,XI E Z h i - j i n g ,Y AN F a n , Y ANG S o n g ― t a o , HUANG Ge n r J . I n s t i t u t e o fMi l i t a r y V e t e r i n a r y , A c a d e my o f Mi l i t a r y Me d i c i n e o f P L A , C h a n g c h u n

1 3

0 0

6 2 , C h i n a ;

2 . De p a r t m e n t o f A n i m a l S c i e n c e a n d T e c h n o l o g y , J i n l i n A g r i c u l t u r a l U n i v e r s i t y ,C h a n g c h u n

1 3

0 1

1 8 , C h i n a ;

3 De p a r t me n t o f A n i m a l S c i e n c e a n d T e c h n o l o g y , T a r i mA g r i c u l t u r a l U n i v e r s i t y , A l a r X i n f i a n g

8 4

3 3

0 0 , C h i n a. J A b s t r a c t :S p i k e ( S ) g e n e o f C a n i n e c o r o n a v i r u s g ia nt p a nd a '

S i s o l a t e ( C C V s t r a i n D X a V I V ) w a s a mp l i f i e d a n dc l o n e d i n t op GEM― Tf o r s e q u e n c i n g .

1 [

1 l ec o mp l e t el e n g t ho f s p i keg e n eo fs t r a i nDⅪMV wa s

4 3

6 2b p . wh i c h e n c o d e d

1 4

5 3 a mi n o a c i d s . T l l e i n i t i a t i v e

1 8 a mi n o a c i d s we r e s i g n a l p e p t i d e . T I l e h o mo l o g i e s o f n u c l e i c a c i d a n d a mi n o a c i d o f s p i ke a m o n g s t r a i n s o f CCV we r e

4 0 .

2 ―

9 9 .