PDF《健康和患病卵形鲳鲹肠道菌群结构的差异》

文章编号: 1000-0615(2019)05-1317-09 DOI: 10.

11964/jfc.20180411227 健康和患病卵形鲳肠道菌群结构的差异 熊向英1 , 王贤丰2 , 彭银辉3 , 王志成1* (1. 广西海洋研究所广西海洋生物技术重点实验室,广西 北海 536000;

2. 北海市海城区国家海域动态监管中心,广西 北海 536000;

3. 北部湾大学海洋学院,广西北部湾海洋生物多样性养护重点实验室,广西 钦州 535011) 摘要:为研究病害发生后卵形鲳肠道菌群结构的差异及其与养殖环境的关系,分析不 同样品中的菌群组成和细菌多样性.实验采用Illumina HiSeq高通量测序技术和生物信息 学分析手段,分别构建了健康鱼水样、患病鱼水样、健康鱼肠道、患病鱼肠道和饵料颗 粒5个样品中菌群的16S rRNA基因测序文库.研究表明,与健康鱼肠道细菌组成相比, 患病鱼肠道中螺旋体门相对丰度显著升高,厚壁菌门和拟杆菌门相对丰度显著降低;

患 病后肠道中的细菌种类仅为健康鱼肠道细菌种类总数的54.94%;

健康卵形鲳肠道菌群 中有73.46%的可操作分类单元(OTUs)与水体样品中OTUs一致,有70.58%与饲料样品一 致,而患病后分别只有17.98%和38.95%的OTUs与水体和饲料样品一致.健康卵形鲳 肠道中黑海弧菌的相对丰度为17.19%,患病后该菌的相对丰度大幅提高,达到78.90%;

健康鱼肠道中鳆发光杆菌占比54.53%,患病鱼肠道中不含鳆发光杆菌.健康和患病鱼肠 道菌群种类组成类似,但存在一定差异,病害的发生会导致肠道细菌多样性显著降低. 健康鱼肠道菌群与养殖环境和颗粒饲料中菌群组成关系密切,而患病后鱼肠道细菌多样 性受环境中菌群的影响较小.黑海弧菌在患病鱼肠道中的大量增殖可能是引起其患病的 重要原因. 关键词: 卵形鲳;

肠道;

养殖水体;

菌群;

高通量测序 中图分类号: S 945.4;

Q

786 文献标志码: A 卵形鲳 (Trachinotus ovatus ),俗称金鲳, 是一种暖水性中上层鱼类,广泛分布于印度洋、太平洋和大西洋的温带及热带海域[1] .因卵 形鲳能在中国南方地区顺利越冬,且适盐范 围广(3~33)[2] 、生长速率较快、出口加工市场前 景诱人等特点,近年来已逐渐成为广西、广东、 海南等地海水网箱养殖主要品种之一.当前卵 形鲳养殖模式绝大多数采用高密度近海网箱 养殖,随着该养殖产业的快速发展和无序扩张, 使得海区负荷过大,养殖环境不断恶化,卵形 鲳细菌病的发生越来越频繁.本实验室于2015―2017年对广西北海网箱养殖卵形鲳的 病害调查中发现,其在养殖过程中长期受细菌 疾病的困扰,表现症状为肠道内有大量黄白色 脓状物、脑干发红、鳃盖出血,部分病鱼眼球 突出[3] . 鱼类肠道中存在大量的微生物,构成了鱼 类肠道微生物区系,这些微生物群落是动物长 期进化的结果,对机体的免疫功能、营养需求 等方面具有重要作用.当鱼类处于健康状态时, 肠道菌群间会形成相对稳定的动态平衡[4-5] ,而 这种平衡一旦被打破,致病菌异常增殖,正常 第43 卷第5期水产学报Vol. 43, No.

5 2019 年5月JOURNAL OF FISHERIES OF CHINA May,

2019 收稿日期:2018-04-04 修回日期:2018-09-18 资助项目:广西自然科学基金(2015GXNSFAA139088);

广西科学院基本科研业务费专项(15YJ22HYS14);

广西科技计划项目 (AB16380167,AB18221112);

广西创新驱动发展专项(AA17204044);

北海市科技计划项目(201884028);