PDF《健康和患病卵形鲳鲹肠道菌群结构的差异》

5 期 熊向英,等:健康和患病卵形鲳肠道菌群结构的差异

1319 http://www.scxuebao.cn 组成类似,相对丰度占前3位的分别为变形菌门 (Proteobacteria)(57.40% vs. 54.88%)、放线菌门 (Actinobacteria)(32.34% vs. 36.15%)和拟杆菌门 (Bacteroidetes)(5.15% vs. 4.26%).变形菌门在H和 D样品中相对丰度均最高,分别为84.96%和82.65%, 差异较大的螺旋体门(Spirochaetes)在D样品中的 丰度为11.03%,远高于其在H样品的丰度(0.04%);

而厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门则相反,其在H 样品中占比分别为7.64%和2.57%,在D样品中则 为2.22%和0.90%,二者相对丰度H样品要高于 D样品.颗粒饲料与水体和肠道的细菌群落组成 不同,蓝细菌门(Cyanobacteria)的相对丰度最高, 为58.00%,其次为变形菌门(30.4%)和厚壁菌门 (7.28%).研究表明,变形菌门是健康和患病卵 形鲳养殖水体和肠道的最主要优势菌,而颗 粒饵料中的最主要优势菌群是蓝细菌门,放线 菌门在养殖水体中占比较大,在肠道和颗粒饲 料样品中占比却很小(图4). 从各样品中菌群丰度高于1%的OTUs进一步 分析菌群结构,H样品中有2种细菌的相对丰度 超过1%,分别为鳆发光杆菌(Photobacterium leio- gnathi) (54.54%)、黑海弧菌(Vibrio ponticus)(17.20%);

D样品中则只有黑海弧菌,占比达到78.92%,其 余细菌均小于1%;

而W1和W2样品菌群结构类似, 图2不同样品中细菌数目的venn分析 图中数字为各样本OTUs数量 Fig.

2 Venn analysis in different samples The number in figure indicates the OTUs in different samples

1320 水产学报43 卷http://www.scxuebao.cn 相对丰度高于1%的细菌为Alpha变形菌HIMB114 (Alpha proteobacterium HIMB114)(6.40% vs. 5.84%)、 Alpha变形菌HIMB59 (2.38% vs. 2.40%)和遍在远 洋杆菌(Pelagibacter ubique)(1.96% vs. 1.48%);

饵料中相对丰度高于1%的细菌有2种,分别为Ph- aseolus vulgar........