PDF《2018 版教学大纲》

第三章第

1 节 讲授 √ √ √

5 《生物信息学》 课程名称(中文/英文) :生物信息学/Bioinformatics 课程编号:1801403 学分:1 学时:总学时

16 学时分配:讲授学时:16 实验学时: 上机学时:0 讨论学时:0 课程负责人:张东升

一、课程简介 1. 本课程主要介绍生物信息学的基础知识.包括生物数据库,序列比对,进化树的构 建,生物分子的结构预测和功能分析等模块. As a new discipline, bioinformatics is growing very fast;

it is becoming a necessary technique in biology labs. This course focuses on practical uses of some important bioinformatics databases and softwares, which includes biological sequence databases, sequence alignment and searching, structure prediction and property characterization, and phylogenetic tree reconstruction. 2. 课程目标: 2.1:通过本课程的学习,让学生初步了解生物信息学的原理和研究方法 2.2:掌握序列数据分析的科学方法,提高学生对于生物信息学的兴趣. 2.3: 通过学习生物信息学,提高学生的科学理论素养,增强民族自信.

二、教学内容 教学内容 学时 备注 对课程目标的支撑度 2.1 2.2 2.3

第一章:生物信息学数据库

1 NCBI 的序列数据库及其发展

2 ENSEMBL 数据库

3 Uniprot 蛋白质数据库

4 作业

1 √ √ √

第二章:序列比对

1 BLAST 的使用

2 CLUSTAL 的使用

3 MEGA 的序列比对

4 作业

2 √ √

第三章:新一代测序技术

1 新一代测序技术介绍

2 序列数据的下游分析

4 作业

3 √ √ √

6

第四章:进化分析

1 通过MEGA进行进化树构建 和评估

4 作业

4 √ √

三、教学方法 案例式、研究式、在线学习、翻转课堂、混合式教学.

四、考核与评价方式及标准 平时作业 40%,课堂表现 10%, 期末考试 50%.

五、课程思政素材

六、参考教材和阅读书目 《生物信息学》陈娟 编高等教育出版社

2014 年12 月第一版

七、本课程与其课程的联系与分工 需要学生有生物化学或者分子生物学的基础. 撰写人:张东升 审核人:范纯新,张宗恩 教学院长:黄旭雄 日期:2018 年11 月18 日 序号 课程思政素材 对应章节 教学 方法 对课程目标的支撑 度2.1 2.2 2.3

1 生物信息学的发展史建立在科学发展的基础 上.从神创论到达尔文的进化论,再到二十世 纪现代生物学的建立,可以让同学们认识到科 学发展的必然性.通过学习生物信息学发展的 历史,了解进化论的产生和发展,加强唯物主 义教育,提高对科学理论如何形成的认识,对 培养同学们的人生观和世界观有很大的帮助. 第1章第2节讲授 √ √ √

2 我国的生物信息学技术发展迅猛,尤其以华大 基因为代表的测序和基因组分析能力,领先全 球.通过了解华大基因参与人类基因组计划, 以及逐渐成为全球领先的基因组研究巨头,可 以帮助同学们树立家国情怀, 增强民族自豪感, 并且鼓励同学们奋发图强,努力奋斗,使我们 国家可以屹立于世界民族之林.

第三章第1节讲授 √

7 《科技论文的写作技法》 课程名称(中文/英文) :科技论文的写作技法(英文 Technique on Writing Scientific Papers) 课程编号:1808021 学分:1 学时:总学时

20 学时分配:讲授学时:8;

实验学时

12 课程负责人:龚小玲 钟俊生 黄旭雄

一、 课程简介 1. 课程概况 《科技论文的写作技法》 是生物科学专业的专业选修课程, 主要讲授生物学领域科技论 文(综述和原创性研究论文)的结构及其写作技法,并介绍论文投稿和发表技巧. 通过课程学习, 学生可以掌握科技论文的结构, 学会遵守学术研究和学术交流的道德规 范,具备撰写生物学科技论文的基本能力. The course, Technique on Writing Scientific Papers, is the professional elective course for Biology Major. It introduces the structure and writing skills on scientific papers (revi ew and original research paper) on biology, and the steps on submission and publish. By the end of this course, students will be able to understand the structure of scienti fic paper and abiding the ethics for academic research and communication. The students al so will have the basic ability to write a biological scientific paper. 2. 课程目标 2.1 学习、理解并掌握生物学科技论文的组成元素和专业步骤,具备根据提供的资料撰 写生物学科技论文的能力;