PDF《丝氨酸组酰胺对 5c -pTpTpCp-3c》

2 .

5 氢键网络 通过半经验算法优化和 HF从头算优化后, L /D-Ser -H ism 与5c -pTpTpCp-3c 的超分子体系形成了较 强的氢键网络, 分别见图 6及表

2 . 可见 L /D-Ser -H ism 中丝氨酸上亲核进攻的羟基 ( ) OH )与5c -pTpT- pCp -3c 磷酸基上的氧形成的氢键、侧链氨基 ( ) NH3 )与磷酸基上另一个氧原子形成的氢键在切割机制 中起关键性作用. Table

2 H-bond net w orks ofL (D )-Ser -H ism and 5c -pTpTpCp -3c * H-bond netw ork Position H ,O /nm L-type /D-type N N( O) ) H ,O /( b) L-type/D-type H-bond netw ork Position H ,O /nm L-type/D-type N N ( O) ) H,O /(b) L-type/D-type Ⅰ O6) H 21,O67 01082/01084 142163/135168 Ⅲ N7) H 12,O82 01214/0

1252 139112 /118156 Ⅱ N1) H 16,O68 01094/01097 113172/132162 Ⅳ N11) H 27,O83 01121/0

1131 138115 /159127 andⅣ are H-bonds for m ed by ) OH, ) NH2, ) CONH2 and l m idazo lylw ith 5c -pTpTpCp -3c segm ent , respectively.

1568 高等学校化学学报Vo. l

28 Fig .

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1 (

1 . School of Chem ical E nqineering and Energy Engineering, South China Un iversity of Technology, Guangzhou 510640, China;