PPT《大型机使用手册》

合作、访问人员不用填写.预设账号为拟开通使用的超级计算机账号,如有冲突,由超算中心重新分配.记帐项目号从项目负责人处获取,并由项目负责人签字.教师有效期如无特别指定,可不用填写;

合作、访问人员需要指定有效期;

学生账号的有效期从申请日期起到规定毕业年份的6月底. 五 账户管理规则 2)账户数目限制 每人只允许使用一个账户.假借他人身份多开账户,将对所有相关账户进行冻结3)账户清理以下情况将被视为非活动账户,自动进行清理账户到期后,给予30天的宽容期,在宽容期内,只能下载备份自己的数据, 30天后账户将被自动清除,并删除所有相关目录6个月内登录次数少于10次的账户将冻结超过一年没有使用的账户,将提前30天通知账户将关闭,30天后自动关闭已离校或已结束合作关系,将提前30天通知账户将关闭,三个月后自动关闭 五 账户管理规则 3)帐户密码规则密码长度至少8个字符长密码中至少需要有一个大写字母密码中至少需要有一个小写字母密码中至少需要有一个数字密码中至少需要一个其他符号(例如,!,@#$%等) 六 计算资源管理 1)计算资源申请每年由项目负责人根据需求按项目进行计算配额申请,年度总配额分别除以12和4后,按30日配额和90日配额进行滑动管理.在任意连续30日/90日内如果超出配额限制,则该项目组的所有账号都需要暂停使用,直到30日/90日累计算量降到配额限制以下才能恢复使用.亦即,整个项目每日的最大可用计算量 = 30日/90日配额 C 前29日/89日的累计计算量每年10月中旬开始进行计算配额申报,截至日期为10月底, 11月中旬将由大型机主管部门组织高性能资源分配协调会,讨论并协调高性能计算资源的最终分配方案 六 计算资源管理 2)计算量统计方式计算量按'

核・小时'

为单位来进行统计独占任务 墙钟小时 x 所用计算节点 x 核数/节点 x 权重系数共享任务核・秒/3600 x 权重系数 七 不允许行为 以下情况将不被允许在登录节点上运行较大需要大资源的程序,导致节点响应缓慢,影响到其他用户绕过作业管理,直接提交任务到计算节点通过使用更改文件时间等手段来干扰/绕过工作目录卷、临时文件目录卷的文件清理机制处理不进行通知,直接中止正在运行的程序第一次违反,将给以警告第二次违反,将立即禁用账号30天第三次违反,立即禁用账号,在项目负责人提出账户解冻申请并做相应承诺后,酌情处理 八作业提交 PBS指令 C 在脚本中以 #PBS 开头#PBS -N jobname 可选设置,作业名#PBS CS /bin/bash指定PBS的Shell为bash#PBS -P project number必需设置,作业项目号,P+9位数字# PBS -q queue必须设置,队列名,Regular, Economy, Longtime (注意: 队列名大小写敏感)#PBS -l nodes=N:ppn=M必须设置,N:节点数, M:每个节点核数#PBS -l walltime=hh:nn:mm可选设置,墙钟限制,不同队列,墙钟限制不一样,最长24小时 八作业提交 #PBS -M me@eartch可选设置,作业报告发送电子邮件地址#PBS -m bea可选设置,作业报告发送状态,b C 开始,e C 结束, a C 中止#PBS CV可选设置,复制用户环境变量#PBS -o jobname.out可选设置,标准输出输出文件#PBS -e jobname.err可选设置,标准错误输出文件注:注释PBS指令,在指令前再加一个 # ,例如:##PBS CV PBS指令也可以通过命令行方式提供,不放到脚本中,指令前不需要加 #PBS 例如:qsub -n helloworld -P P123456789 -l nodes=2:ppn=12 -l walltime=00:05:00 -q Regular job.sh 八作业提交 变量名说明登陆SHELL继承来的变量 包括$HOME,$LANG,$LOGNAME,$PATH,$MAIL,$SHELL和$TZ. $PBS_O_HOST qsub提交的节点名称 $PBS_O_QUEUE qsub提交的作业的最初队列名称 $PBS_O_WORKDIR qsub提交的作业的绝对路径 $PBS_JOBID 作业被PBS系统指定的作业号 $PBS_JOBNAME 用户指定的作业名 $PBS_NODEFILE PBS系统指定的作业运行的节点名 $PBS_QUEUE PBS脚本在执行时的队列名 2. PBS的环境变量 八作业提交 3. 命令运行方式 MPI程序mpirun -n np mpi_app.exeOpenMP程序export OMP_NUM_THREADS = np./omp_app.exe串行程序./serial_app.exe 八作业提交 示例一MPI并行作业,使用两个节点,每个节点12个核#!/bin/bash #PBS CS /bin/bash#PBS -N helloworld#PBS -P P123456789#PBS -q queue Regular#PBS -l nodes=2:ppn=12#PBS -l walltime=00:05:00cd $PBS_O_WORKDIRnprocs=`cat $PBS_NODEFILE | wc -l`mpirun -np $nprocs ./hello.exe 八作业提交 示例二串行作业,使用1个节点,4个核运行4个任务#!/bin/sh…#PBS -l nodes=1:ppn=4…cd $WORK_DIR1/usr/bin/time myapp1.exe &